Естественнонаучный профиль ориентирует на такие сферы деятельности, как медицина, биотехнологии, химическая промышленность. В данном профиле на углублённом уровне изучается химия, биология. Совместно с Новгородским государственным университетом имени Ярослава Мудрого на данном профиле организован медико-биологический класс. Дополнительно изучается биофизика, биохимия, введение в медицину. Профильные предметы преподают опытные учителя с высшей квалификационной категорией.
В первую очередь, естественно-научный профиль открывает двери в профессию медика. Здесь много направлений и возможностей. Но естественно-научный профиль — не только про медицину. Можно стать специалистом в сфере геодезии и землеустройства, экологии и природоустройства, геологии и разработки полезных ископаемых, биоинженерии, реконструкции и реставрации объектов культурного наследия, ландшафтной архитектуры и других направлений.
Естественно-научные специальности продолжат быть востребованными — познание окружающего мира не прекратится никогда. Уверенное знание химии и биологии открывает многие двери.